Hoefer SE600系列专为2-D电泳的第二维分离设计，兼容一维等电聚焦后的IPG胶条或管状凝胶。用户将聚焦完成的IPG胶条放置于浓缩胶顶部，用熔化的琼脂糖（溶解于电泳缓冲液）封固，注意避免在胶条与第二维凝胶之间困住气泡。对于SE660的长凝胶，可容纳更长的一维胶条，提供更好的第二维分离效果。Hoefer SE600系列的大板设计为2-D电泳提供了足够的分离距离，确保复杂的蛋白质组样品能够获得清晰的斑点图谱。说明书提供了针对2-D电泳的灌胶指导，包括分离胶灌制高度和样品处理建议。Hoefer SE600X垂直电泳仪的中心组件拆装无需工具，操作简便。模块化设计垂直电泳仪
SE640 Wide-Mini垂直电泳仪为追求快速、中等通量的实验室提供了一个紧凑而高效的解决方案。它采用18×8厘米的独特凝胶板格式，可同时检测112个样本，在保持较高通量的同时，简化了凝胶的制备和操作流程。电泳时凝胶完全被缓冲液浸没，从而实现高效的散热。这款垂直电泳仪专为需要快速获得结果的应用场景设计，如样品纯度检测或蛋白表达诱导时间的筛选。其“三明治”结构配置允许用户在一次运行中处理多达4块凝胶，兼顾了速度与效率，是繁忙实验室的理想选择。模块化设计垂直电泳仪Hoefer SE660垂直电泳仪在生物制药中用于单抗纯度检测。
在垂直电泳仪运行过程中，监测示踪染料的迁移是判断电泳终止时间的直观方法。样品缓冲液中通常加入溴酚蓝或二甲苯青等示踪染料，这些染料分子量小、带电荷，在电场中的迁移速度通常比样品中的目标蛋白或核酸大分子快得多。实验者可以观察这些有色染料在凝胶中移动的位置，当染料前沿移动到距离凝胶底部边缘约0.5-1厘米时，即可停止电泳，确保样品条带不会跑出凝胶。对于SDS-PAGE，溴酚蓝的迁移速度**快，通常作为主要示踪染料；二甲苯青迁移较慢，适用于监测高分子量蛋白的分离进程。对于核酸电泳，溴酚蓝在1%琼脂糖凝胶中约相当于300 bp DNA片段的迁移位置，二甲苯青则约相当于4 kb DNA片段的位置，这一对应关系可以帮助实验者粗略估算目标片段的位置。示踪染料的颜色变化还可以提供电泳系统状态的实时信息：如果染料前沿出现弯曲或扭曲，提示可能存在凝胶不均一或电场分布不均匀的问题；如果染料迁移速度异常缓慢或过快，提示缓冲液或电源设置可能存在问题。此外，某些预制胶或特殊电泳系统中可能使用其他示踪染料，操作者应熟悉所用体系的染料特性。通过观察示踪染料，实验者无需依赖精密计时即可准确把握电泳进程，这一简单而有效的方法使垂直电泳仪的操作更加直观、可控。
SE400系列支持线性梯度凝胶的制备，适用于需要分离宽分子量范围样品的应用。用户可使用Hoefer SG系列梯度混合仪，通过蠕动泵将低浓度和高浓度丙烯酰胺溶液按比例混合，从凝胶三明治底部灌入。梯度凝胶可在同一块胶上同时分离大分子和小分子蛋白，避免因凝胶浓度选择不当导致部分样品无法有效分离。说明书中提供了10%-20%梯度凝胶的配方示例，并建议在高浓度溶液中添加蔗糖或甘油以改善分层效果。梯度凝胶对灌胶技术要求较高，但SE400的制胶支架设计为这一操作提供了稳定支撑。Hoefer垂直电泳仪在分析高分子量蛋白时，应选择低浓度凝胶。
垂直电泳仪冷却介质的选择对于保护设备冷却系统至关重要，所有配备外接循环冷却功能的Hoefer垂直电泳仪（包括SE260、SE600、SE660、SE900等型号），其冷却**和热交换器内部流道均由特定材料制成，对冷却液的化学成分有严格要求。只能使用水或不超过50%乙二醇的水溶液作为冷却介质。纯水是**安全、**常用的冷却液，具有高比热容和良好的导热性能，适用于大多数电泳实验。在需要将冷却温度设置在冰点以下（如4℃以下）的实验中，可以添加乙二醇以降低冷却液的冰点，防止结冰损坏设备。但乙二醇浓度不得超过50%，否则可能影响热交换效率和材料兼容性。严禁使用汽车防冻液或任何含有酒精、防锈剂、润滑剂等添加剂的混合物，因为这些化学物质可能会与**组件的密封材料、金属部件发生化学反应，导致密封垫溶胀、老化加速或金属腐蚀，进而引发泄漏或性能下降。在连接冷却管路时，还需注意循环水浴的压力设置——说明书明确规定循环压力不得超过环境压力以上0.8 bar（约12 psi），严禁将冷却**直接连接到未调节压力的自来水龙头。使用恒流泵或循环水浴来控制压力和流量是安全操作的***方式。严格遵守冷却介质的选择和使用规范，可有效保护电泳仪的**部件，延长使用寿命。Hoefer垂直电泳仪在突变检测中，用于分辨单碱基差异的片段。翻译后修饰分析垂直电泳仪技术指导
Hoefer垂直电泳仪的SE640采用铰链式卡盒，凝胶组装快速简便。模块化设计垂直电泳仪
垂直电泳仪的维护和清洁是保证其长期稳定运行、获得可重复性结果的基础性工作。Hoefer建议用户在每次使用后，及时拆解设备并用温和的实验室洗涤剂彻底清洗各个部件。具体操作步骤包括：首先，拆卸所有凝胶夹层、弹簧夹、**组件等可拆部件；然后，用软刷和稀释的中性洗涤剂清洗缓冲液槽、**组件、玻璃板、梳子等，特别注意清洗电极周围和密封垫沟槽等容易残留缓冲液结晶的区域；用大量去离子水冲洗干净，确保无洗涤剂残留；***，将各部件自然晾干或用无尘纸擦干后存放。对于**组件上的硅胶密封垫，应定期检查是否有划痕、裂纹、硬化或变形等老化迹象。密封垫是保证上缓冲液室防漏的关键部件，其状态直接影响电泳成败。清洁后，可以在密封垫上薄薄涂一层硅脂或密封油脂，这既能保持硅胶的弹性，确保良好的密封性，又能防止因长期干燥使用导致的龟裂。玻璃板的清洁尤为重要——残留的凝胶碎片或蛋白质污染物可能导致下次灌胶时产生气泡或影响条带质量。对于顽固的凝胶残留，可以使用0.1 M NaOH溶液浸泡后轻柔擦洗，但需避免使用强酸或强碱性清洁剂，以免损伤玻璃板表面的平整度。定期、规范维护不仅能延长垂直电泳仪的使用寿命，更是获得高质量、可重复电泳结果的重要保障。模块化设计垂直电泳仪
