在宿主细胞残留 DNA 检测中，若回收率不合格，可按以下思路排查。先看 PCS/NCS，检查 PCS 回收率是否合格、计算公式是否正确，以及 NCS 质控是否合格 。接着排查试剂 / 耗材，确认洗涤液 B 是否过期或配制错误，异丙醇是否为分析纯，常温试剂有无结晶，试剂储存温度是否合适，磁珠是否难重悬 。再关注样品，了解样品残留量、加标量是否合适，pH 值是否异常，是否含抑制因子干扰磁珠作用和 PCR 实验 。以上排查完再审视操作过程，查看样品是否完全消化、消化后状态是否可流动，磁珠是否复温，洗涤 / 洗脱中磁珠状态、是否被误丢弃，洗脱前磁珠是否过干燥等 。
宿主细胞残留DNA检测数据是产品放行的重要依据。吉林E.coli宿主细胞残留DNA检测常见问题
SHENTEK®质粒 DNA 残留检测试剂盒用于定量检测基因治疗产品中质粒 DNA 残留的检测试剂盒，如 CAR-T 细胞中慢病毒载体制备相关的质粒 DNA。本试剂盒利用 Taqman 探针原理，通过各质粒共有 DNA 序列， 如ColE1/pMB1/pBR322/pUC 来源的复制子，定量检测样品中质粒 DNA 的残留。客户可以事先将质粒 DNA 序列给湖州申科生物技术人员进行确认。本试剂盒检测快速，专一性强，性能可靠，检测限可以达到 102 copies/μL。试剂盒配套有质粒DNA 定量参考品。本试剂盒与 SHENTEK®宿主细胞残留 DNA 样本前处理试剂盒配套使用，可准确定量样品中残留的微量质粒 DNA。
上海CHO宿主细胞残留DNA检测方案实时定量PCR（qPCR）凭借高灵敏度和特异性，成为宿主细胞残留DNA检测的主流方法。
在开展宿主细胞残留 DNA（HCD）检测方法验证前，需从文件要求与样品处理两方面考量。文件要求上，应通过研究方案、研究计划、报告或标准操作程序（SOP）的形式，预先详细规定生物分析方法的具体内容，为后续验证筑牢规范基础 。样品处理方面，若检测时样品存在抑制情况，可考虑稀释，但稀释后检测值需处于可信范围；对于复杂样品，若稀释无法消除抑制，要借助样品前处理方式提取 DNA 后再检测，以此保障检测结果准确可靠，确保 HCD 方法验证顺利、有效推进 。
疫苗、抗体、重组蛋白、多肽、小分子药物等产品多采用连续传代细胞系表达生产。虽然经过了多步纯化工艺，但终产品仍可能残留来自宿主细胞的DNA（Host cell DNA,HCD）,HCD中可能包含功能基因，若其含有显性致病基因或病毒基因组，未经验证、充分去除或灭活的宿主细胞DNA残留在制品中，可能通过基因水平的随机插入突变，或是激发过度/异常的免疫原性反应，给用药者带来不可预测的重大健康威胁。因此，定量检测宿主细胞残留DNA对监测药物产品的安全性和质量可控性具有重要意义。样本核酸处理、试剂盒及检测系统共同决定宿主细胞残留 DNA 检测稳定性。
宿主细胞残留 DNA 检测稳定性由三方面决定。样本核酸处理可选用磁珠法或碘化钠法，提取方式有手工或自动化，关键是要有效去除杂质抑制物，且适配复杂样本，保障后续检测基础；qPCR 检测试剂盒涉及标准品，以及含 Mastermix、引物、探针、缓冲液、稀释液的反应体系，其质量与配置影响检测准确度；检测系统主要是 qPCR 仪器，仪器性能与稳定性关乎检测数据可靠性。三者协同，从样本处理、试剂质量到检测设备，共同构建宿主细胞残留 DNA 检测稳定体系 。
DNA提取效率是影响检测结果的关键因素，需通过优化裂解与纯化方法提高回收率。湖南E.coli宿主细胞残留DNA检测常见问题
SHENTEK® 系列宿主细胞残留DNA检测试剂盒专属性强，不受其他工程细胞基因组干扰。吉林E.coli宿主细胞残留DNA检测常见问题
湖州申科生物疫苗制剂宿主细胞残留DNA样本前处理试剂盒的核酸提取纯化为磁珠法，针对疫苗制剂的产品特点，优化了试剂配方，用于疫苗成品，如Vero细胞生产的狂犬病疫苗中的Vero残留DNA的样品前处理，可稳定高效地获得样品中的痕量DNA，可与各个SHENTEK®宿主细胞DNAqPCR检测试剂盒配合使用。本试剂盒可以通过 rHCDpurify®前处理系统实现样品的自动处理。如样品中含有铝佐剂或右旋糖苷，具体处理方法可咨询湖州申科生物技术股份有限公司。
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