培养基配制后一般都有沉渣或混浊出现医学，需过滤成清晰透明后方可使用，常用的过滤方法如下：1.液体培养基：液体培养基必须清晰，以便观察细菌的生长情况，常用滤纸过滤，亦可在加热前加入用水稀释的鸡蛋白（1000ml培养基用1个鸡蛋白）在100℃加热后保持60～70℃，40～60分钟，使其不溶性物质附于凝固的蛋白上而沉淀，然后再用虹吸法吸出上清液或以滤纸过滤。2.固体培养基：如系琼脂培养基，于加热融化后需趁热以绒布或两层纱布中夹脱脂棉过滤；亦可用自然沉淀法，即将琼脂培养基盛人铝锅或广口搪瓷容器内，以高压（103.43kPa）蒸汽融化15分钟后，静置高压锅内过夜，次日将琼脂倾出，用刀将底部沉渣切去，再融化即可收清晰的琼脂培养基。培养基制备器功能强大的加热器，能够迅速加热。山东自动搅拌培养基制备器
分接触和利用培养基中的养料，适于作生理等研究，由于发酵率高，操作、方便，也常用于发酵工业。(3)半固体培养基。是在液体培养基中加入少量凝固剂而呈半固体状态。固体培养基的制作步骤：1、首先我们要准备好一个装有1000ml的烧杯，然后在准备好的杯中在放入500ml的蒸馏水，在将牛肉膏和蛋白胨、氯化钠这些都溶解在水中。2、其次我们在调节PH值，调节时需要百分之10的氢氧化钠溶液，将PH值调到7.2，在此也要定容到1000ml，较后在将这些液体都分别放入10个锥形瓶内，每一瓶都装100ml。浙江Systec培养基制备器培养基制备器是一类化学成分和数量完全知道的培养基，它是用已知化学成分的化学药品配制而成。
杀毒灭菌方式主要有三种类型：⑴高压蒸汽灭菌方式，此方法可用于大多数耐热培养基。⑵煮沸灭菌法方式：此方法可用于含有不耐高温物质的培养基。⑶过滤除菌方式：过滤除菌，采用无菌技术定量添加培养基。血液和可以用无菌技术抽取并加入冷却至约五十度的培养基中。当培养基中含有不耐热物质时可以使用此方法。培养基倒入平板：将灭菌溶化的培养基冷却至五十度后，倒入无菌干燥的培养皿中。微生物培养基制备的温度不能太高，否则培养皿内盖容易形成过多的冷凝水。
配制好的培养基保存：灭菌以后培养基应该迅速冷却至所需温度，避免长时间保存在灭菌锅内，造成过度灭菌，影响培养基的营养成分或选择性效果。所配制的培养基的量，应该是在较长保存期限内正好使用完。含染料的培养基应闭光保存;倒好的琼脂平板如果配制的当天未使用完，应于冷藏保存，如果保存时间超过2天，应将其放入密封的塑料袋中保存;配好的肉汤类培养基如果保存时间超过2个星期，应将其放在带有螺旋盖的试管或其它密闭的试管或容器中防止蒸发。培养基各成份的混合和溶化：培养基所用化学药品均应是化学纯的。
培养基制备技术：一、玻璃器皿的清洗：在制备培养基的过程中，首先要使用一些玻璃器皿，如试管、三角瓶、培养皿、烧杯和吸管等。这些器皿在使用前都要根据不同的情况，经过一定的处理，洗刷干净。有的还要进行包装，经过灭菌等准备就绪后，才能使用。1、新购的玻璃器皿：除去包装沾染的污垢后，先用热肥皂水刷洗，流水冲净，再浸泡于１～２％的工业盐酸中数小时，使游离的碱性物质除去，再以流水冲净。对容量较大的器皿，如大烧瓶、量筒等，洗净后注入浓盐酸少许，转动容器使其内部表面均沾有盐酸，数分钟后倾去盐酸，再以流水冲净，倒置于洗涤架上将水空干，即可使用。2、用过的玻璃器皿：凡确无病原菌或未被带菌物污染的器皿，使用后可随时冲洗，吸取过化学试剂的吸管，可先浸泡于清水中，待到一定数量后再集中进行清洗。有可能被病原菌污染的器皿，必须经过适当消毒后，将污垢除去，用皂液洗刷，再用流水冲洗干净。全自动培养基制备仪主要特点：水蒸气高温灭菌，保证整个制备过程在无菌下进行。山东自动搅拌培养基制备器
培养基的不正确制备会导致培养基出现质量问题。山东自动搅拌培养基制备器
培养基的分装：培养基的分装，应按使用的目的和要求，分装于试管、烧瓶等适当容器内。分装量不得超过容器装盛量的2/3。容器口可用垫有防湿纸的棉塞封堵，其外还须用防水纸包扎（现试管一般多有用螺旋盖者）。分装时好好能使用半自动或电动的定量分装器。分装琼脂斜面培养基时，分装量应以能形成2/3底层和1/3斜面的量为洽当。分装容器应预先清洗干净并经干烤消毒，以利于培养基的彻底灭菌。每批培养基应另外分装20ml培养基于一小玻璃瓶中，随该批培养基同时灭菌，以为测定该批培养基好终pH之用。山东自动搅拌培养基制备器
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