Cre重组酶在基因编辑中的操作主要涉及以下几个步骤:1.**识别与结合**:-Cre重组酶首先识别并分别结合两个LoxP序列的两个反向重复序列,形成一个二聚体。2.**四聚体形成**:-两个二聚体互相靠近,形成由四个Cre分子与两个LoxP位点结合形成的四聚体复合物。3.**DNA切割与交换**:-Cre重组酶在每个LoxP位点的间隔序列中引导单链切割,产生带有3’端羟基的断裂。每个LoxP位点的两个单链分别被切割。切割产生的自由3’端与对侧的3’端进行交换和重连,形成Holliday交叉结构。4.**分子重组与解旋**:-Holliday交叉结构通过Cre酶的作用被解旋并重组,形成新的重组产物。这个过程导致两个LoxP位点之间的DNA序列被删除、反转或易位,具体效果取决于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**条件性基因编辑**:-通过建立特异性Cre小鼠,该小鼠中的Cre重组酶由特定启动子驱动,可在特定细胞或组织或全身表达Cre重组酶。与带有Lox位点的Flox小鼠杂交,子代中可以获得既带有Cre又带有Flox基因的小鼠,实现条件性基因打靶(表达或敲除靶基因)。Cas9 NLS在Cas9蛋白的N端和C端都含有SV40 T抗原的核定位序列,这使得Cas9与gRNA形成的复合物。Recombinant Mouse APOA5 Protein,His Tag

在DNA提取过程中避免RNA污染的关键在于采取一系列措施来确保RNA被有效去除或降解,同时保护DNA的完整性和纯度。以下是一些确保DNA提取过程中避免RNA污染的策略:1.**使用专门的DNA提取试剂盒**:选择高质量的DNA提取试剂盒,这些试剂盒通常已经包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和纯化步骤,能够有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)处理**:在DNA提取过程中加入RNase处理步骤,可以有效地去除残留的RNA污染。RNase是一种能够特异性降解RNA的酶,可以在不影响DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**优化实验操作步骤**:在破碎细胞时,选择合适的破碎方法和破碎时间,避免过度破碎导致RNA的释放;在DNA纯化阶段,控制好离心速度和时间,避免RNA的沉淀。4.**使用无RNase的试剂和耗材**:使用经过RNase-free处理的实验器材和试剂,确保实验过程中不会引入外源性RNA污染。5.**严格控制实验环境**:保持实验室台面和工作区域干净无尘,定期对实验室进行消杀,避免RNA酶污染。6.**个人防护和操作规范**:在处理DNA样品时,佩戴无菌手套和口罩,以减少呼吸道和皮肤污染的风险。使用不同的工具处理不同的样品,或者在处理前后彻底清洗工具,避免交叉污染。溴酚蓝蔗糖溶液(0.25%)泛素分子可以通过其内部的赖氨酸残基(如Lys48)与其他泛素分子形成多聚泛素链。

T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因编辑中的应用主要体现在突变体检测和基因编辑效率评估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具体应用步骤和特点:1.**基因编辑效率评估**:-T7EI用于评估CRISPR-Cas9在给定的导向RNA靶位点上对细胞群体进行基因编辑的效率。-通过PCR扩增围绕CRISPR导向RNA靶位点的基因组DNA,如果CRISPR-Cas9介导的非同源末端连接(NHEJ)修复事件引入了突变,变性和退火将形成突变型和野生型PCR扩增子的异源双链DNA。2.**突变体检测**:-如果CRISPR/Cas9编辑成功在DNA上引入突变,则可与野生型DNA片段退火产生异质双链DNA。T7EI可以识别该DNA上的不完全配对的DNA位点然后进行双链切割,通过琼脂糖凝胶电泳即可显示酶切后的条带,从而半定量判定基因编辑效果。-T7EI能识别长度大于或等于2bp的插入、缺失或突变导致的错配DNA,不能识别1bp的插入、缺失或突变。3.**实验步骤**:-收集细胞并提取基因组DNA,然后使用PCR扩增期望编辑的基因组区域。扩增子的长度建议为0.5-1kb。-对扩增的DNA进行变性和退火复性,以产生异质双链DNA。-使用T7EI酶处理退火后的DNA产物,在37℃孵育15分钟。
BsuDNAPolymerase(嗜热脂肪芽孢杆菌DNA聚合酶)与其他DNA聚合酶相比,具有一些独特的特性和优势:1.**链置换活性**:BsuDNAPolymerase保留了BacillussubtilisDNA聚合酶I的5'→3'聚合酶活性,但缺乏5'→3'核酸外切酶结构域,这使得它具有链置换DNA合成的能力。这种能力对于等温扩增技术如重组酶聚合酶扩增(RPA)和环介导等温扩增(LAMP)非常重要,因为它可以分离双链DNA,允许新的DNA链的合成。2.**温度稳定性**:BsuDNAPolymerase在高温下保持活性,这使得它适用于需要在较高温度下进行的扩增反应,如RPA技术中的65°C反应条件。3.**无核酸外切酶活性**:BsuDNAPolymerase缺乏3'→5'和5'→3'核酸外切酶活性,这意味着它不会像某些其他聚合酶那样在合成过程中具有校对功能。这可以减少非特异性扩增,提高扩增的特异性。4.**高灵敏度和特异性**:BsuDNAPolymerase在等温扩增中展现出高灵敏度,能够将微量核酸模板扩增到可检测水平,同时保持高特异性。5.**简化的操作流程**:与其他需要复杂操作和多个步骤的DNA聚合酶相比,BsuDNAPolymerase在等温扩增技术中的应用简化了操作流程,因为它不需要热循环仪,这使得它适合现场快速检测和诊断。

在质粒DNA提取过程中,确保DNA的完整性和活性至关重要,这通常涉及以下几个关键因素:1.**温和的裂解条件**:选择适当的裂解方法对于保持DNA的完整性至关重要。对于大于15kb的质粒DNA,应采用温和的裂解方法,如将细菌悬浮于等渗的葡萄糖溶液中,加入溶菌酶和EDTA破坏细胞壁和细胞膜,以减少对质粒DNA的机械剪切力,从而保护其完整性。2.**避免过度裂解**:在质粒提取过程中,并非裂解时间越长越好。过长的裂解时间可能会造成基因组DNA片段的污染,影响质粒的纯度。3.**适当的洗涤和洗脱**:在纯化过程中,适当的洗涤可以去除蛋白质和其他杂质,但过度洗涤可能会导致DNA的损失。洗脱步骤中,确保洗脱液完全浸润柱膜,以保证结合在柱膜上的质粒得以充分洗脱,避免因洗脱体积过小而影响质粒得率。4.**避免DNA的降解**:在提取过程中,添加核酸酶抑制剂可以防止DNA被核酸酶降解。同时,避免长时间将DNA暴露在室温下,以及避免多次冻融循环,这些都有助于保护DNA的完整性。5.**低温操作**:尽量在低温条件下进行提取操作,以减少核酸酶的活性,从而保护DNA的完整性。
通过优化crRNA的设计,可以提高FnCas12a的特异性和灵敏度,例如在microRNA检测中 。Recombinant Mouse APOA5 Protein,His Tag
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,简称λExonuclease)是一种具有特定特性和应用的酶,以下是其主要特点和应用:1.**特异性作用**:λExonuclease是一种5'→3'核酸外切酶,能选择性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的双链DNA。2.**酶切活性**:对单链DNA和5'端未磷酸化修饰的DNA的酶切活性较低,不能从DNA的切刻或缺口处起始消化。3.**嗜磷酸性**:该酶具有非常强的嗜磷酸性,磷酸化的核酸链与非磷酸化的核酸链的切割效率相差达200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一种具有高度持续性的碱性核酸外切酶,可以连续地将核酸切割成为单个碱基,切割比较高速率可以达到1000nt/S。5.**应用领域**:-生成单链PCR产物用于DNA测序。-DNA单链构象多态性(SSCP)分析。-滚环扩增。-从双链DNA片段生成单链DNA。-PCR产物的克隆。-质粒制备净化。6.**酶活性定义**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37ºCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。Recombinant Mouse APOA5 Protein,His Tag
在分子生物学研究中,核酸染色是检测DNA和RNA的关键步骤,而溴化乙锭(EthidiumBromide,EB)作为一种经典的荧光染料,因其高效性和灵敏性被广泛应用于核酸电泳、荧光分析等领域。产品特点高灵敏度与特异性EB是一种多环芳烃荧光小分子,能够特异性地嵌入双链DNA和RNA中。结合后,其荧光强度增强,双链RNA和双链DNA的荧光强度分别可增强21倍和25倍。这种特性使得EB能够检测到低至10ng的DNA条带,非常适合用于微量核酸的检测。多种应用EB不仅用于琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳中的核酸染色,还可以作为DNA聚合酶抑制剂,用于核酸的荧光分析实验。此外,EB还可与吖啶橙联合使用,用...