对于涉及完整Fab或Fc抗体片段的应用,需要在抗体铰链处进行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等传统酶可用于生成 Fab 片段,但非特异性酶活性需要仔细优化,以极大限度地降低多个消化位点的风险。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一个消化位点,可从人 IgG1 生成均质的 Fab 和 Fc 抗体片段。生成的片段可用于结晶和高阶结构 (HOS) 的 NMR 研究、结合研究等。在这里,我们提出了获得完整Fab和Fc抗体片段的不同策略。所得片段显示 GingisKHAN 的有效消化,用于生成完整的 Fab 片段或从依那西普上的融合 TNFR 结构域中分离 Fc。由于 GingisKHAN 的特异性消化依赖于 IgG 的天然折叠,因此在变性条件下特异性受到负面影响。为了使用SDS-PAGE分析消解效率,在加入SDS上样缓冲液之前,停止在分析样品中加入碘乙酰胺的反应。Genovis同时提供IdeS酶的纯化试剂盒。FabDELLO 是从 Bdellovibrio 细菌克隆而来的,并在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签,分子量为 32 kDa。山东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学

蛋白酶用于生成肽,用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影,传统的蛋白酶并不总是理想的,因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶,可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比,所得肽更长,并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物,使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性,即使在长时间孵育过夜后,酶与底物的比例也很高(1:5)。然而,ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性,但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1:20 和过夜孵育下,证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下,GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性,并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。山东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学如mAb在生产或储存过程中的氧化,它可能会影响zhiliao产品的质量。

与IdeS不同,融合蛋白是通过将两种或多种蛋白质或肽的功能组合成一个量身定制的分子来创造的,以专门应对挑战。连接此类蛋白质或肽结构域的常见方法是包含柔性连接子。这些连接子通常富含甘氨酸,例如甘氨酸残基(G),或甘氨酸残基散布丝氨酸残基(GS)以形成重复序列。这为连接子提供了足够的灵活性,不会干扰连接蛋白质结构域的功能。然而,这些新模式带来了新的分析挑战,需要新的工具来促进表征和产品质量监测。中级分析已成为分析单克隆抗体疗法的标准方法,涉及将分子消化成几个定义的亚基。它们足够小,可以获得高质量的质谱图,并为产品质量属性提供特定领域的信息。由于G和GS连接子对常见蛋白酶的降解具有抗性,因此很难分离结构域以进行深入分析。因此,Genovis开发了GlySERIAS,不同于IdeS酶,一种消化柔性富含甘氨酸的连接子的酶。GlySERIAS可以分离不同的功能域,并实现对融合蛋白、多特异性抗体和含有富含甘氨酸的连接子的各种mAb片段进行详细表征的中级方法。
与IdeS不同,Genovis的GingisKHAN(Kgp)是一种半胱氨酸蛋白酶,可在铰链上方的单个位点(KSCDK/THTCPPC)消化人IgG1,产生完整且均质的Fab和Fc片段。GingisKHAN是一种赖氨酸特异性蛋白酶。单一的消化位点是人IgG1三维结构的结果,使这种赖氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖,则Fc上暴露的赖氨酸处可能会出现额外的消化位点。GingisKHAN需要温和的还原条件才能具有活性,并且在37°C和pH8下获得活性。还原剂(2mM半胱氨酸)与酶一起提供。GingisKHAN是从牙龈卟啉单胞菌中纯化的。该酶用于使用LC-MS表征基于抗体的生物zhiliao药物,研究Fc聚糖分析、双特异性抗体、亲和力和亲和力效应,并鉴定翻译后修饰。Genovis的IgASAP 是 IgA 消化酶家族。

为什么客户想在他们的工作试用Genovis的FabRICATOR(IdeS)。FabRICATOR的高特异性(在铰链下方有单个消化位点)以及它对IgG种和亚类表现出活性的事实使其成为高效表征一系列不同分子的理想工具。FabRICATOR的另一大优势是速度。在大多数IgG上,您可以在短短30分钟内生成F(ab’)2和Fc/2片段,这一速度简化了方法开发,并允许快速有效的中层表征,使客户能够在不比做完整质量实验长太多的时间内获得更多关于分子的信息。Genovis发现更多的缓冲液与溶液中的FabRICATOR消解相容(更多信息)。Genovis已经测试了PBS和150mM醋酸铵,pH7,结果良好。并且应该也适用于FabRICATORHPLC。然而,缓冲液的离子强度会影响抗体片段在FabRICATORHPLC(IdeS)色谱柱上的保留,并且IgG1亚基需要至少100-150mM盐才能洗脱为单个窄峰。其他IgG亚类或融合蛋白可能需要对缓冲液组成进行一些优化。Genovis的FabRICATOR MagIC可用于自动分析和监测不同的CQA。安徽GingisREXIdeS蛋白酶抗体酶切
为了降低度拉糖肽复杂性,使用GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖,并用DTT还原链间二硫键。山东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学
经过多年的经验积累及市场积淀,倍笃生物已组合多条不同产品线,分别满足体外诊断、organoid及干细胞、细胞基因药物等领域的需求。其中,细胞基因药物领域产品线包含SAN HQ高盐核酸酶及M-SAN HQ中盐核酸酶、泊洛沙姆P 188 Bio、GMP级MSC/PSC培养基、GMP级胶原酶、AAV滴度检测产品、工艺杂质及外源污染物残留检测产品、聚糖分析用酶、ADC偶联技术、QED抗体对、AAV中和抗体、蛋白酶等;相关品牌有挪威ArcticZymes Technologies、德国BASF、德国Sartorius、德国Nordmark、瑞典Genovis、美国QED、中国君研生物等。山东GlySERIASIdeS蛋白酶蛋白组学
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