免疫沉淀Co-IP实验中磁珠还是琼脂糖珠的选择取决于客户实验情况。
琼脂糖珠海绵状的结构 (直径 50-150 μm) 可以结合抗体 (继而结合靶蛋白) ,它能够直接高效、快速结合抗体,而不需借助特殊的专业设备。琼脂糖珠呈多孔结构,这使得它们拥有更大的表面积可与蛋白质相互接触,具有更高的结合载量。
与琼脂糖珠不同,磁珠是固体,抗体的结合限于磁珠的表面。磁珠 (直径 1-4 μm) 明显小于琼脂糖珠 ,尽管磁珠没有多孔中心增加结合能力,但每体积的磁珠数量比琼脂糖珠多,使磁珠拥有足够的抗体结合表面积满足高容量的抗体结合。
简而言之,琼脂糖珠的结合能力较强,而磁珠在得率,可重复性以及自动化方面有明显的优势。
免疫沉淀RIP抗体的选择?温州anti Flag免疫沉淀磁珠原理
免疫沉淀技术的实验方法通常包括以下步骤:
1. 样本准备
2. 细胞裂解:使用裂解缓冲液(含有蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解)裂解细胞,释放蛋白质。
3. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
4. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
6. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
7. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。
8. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱免疫复合物。
9. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。
10. 对照实验:包括正对照(已知能沉淀目标蛋白的抗体)和负对照(非特异性抗体或无抗体)以验证实验的特异性。
南京ChIP免疫沉淀磁珠价格免疫沉淀技术RIP的应用有哪些?
免疫沉淀纯化所得抗原纯度低一般有多种原因:
1. 非特异性蛋白污染
如果洗脱所得抗原纯度较低,则有几种方法可以进行优化。在结合或洗涤缓冲液中加入去污剂或其他可以降低非特异性结合的组分。使用普通微珠预纯化样本还可以降低非目标分子的共纯化。此外,还可以使用无关蛋白 (如BSA) 封闭微珠 。
2. 抗体污染
使用蛋白A、G或A/G的经典免疫沉淀实验中会出现抗体与抗原共洗脱的情况。如果共洗脱会影响下游分析,则需要使用抗体通过共价连接固定至微珠的方法进行实验,如Pierce 直接 IP 或交联 IP 的形式。
ChIP技术的应用:
1. 转录因子结合位点的鉴定:研究特定转录因子在基因组上的结合模式。
2. 组蛋白修饰的分布:分析不同组蛋白修饰在基因组上的分布情况,这些修饰与基因的活跃或沉默有关。
3. DNA甲基化研究:结合ChIP技术可以研究DNA甲基化对基因表达的影响。
4. 染色质结构和功能:研究染色质重塑对基因表达和细胞功能的影响。
5. 疾病相关基因的调控:研究疾病状态下基因调控网络的变化。
ChIP技术是表观遗传学研究中的一个重要工具,它可以帮助科学家们理解基因表达是如何在分子水平上被精确调控的。
免疫沉淀技术RIP实验步骤。
ChIP(染色质免疫沉淀)实验是一种用于研究蛋白质与DNA相互作用的技术。以下是ChIP实验的实验方法概述:
1. 交联:将细胞与交联剂(如1%甲醛)孵育,通常在室温下进行10-15分钟。
2. 终止交联:添加甘氨酸以终止交联反应,孵育5分钟。
3. 收集细胞:通过离心收集细胞,并用PBS洗涤以去除交联剂。
4. 细胞裂解:使用裂解缓冲液裂解细胞,释放染色质。
5. 染色质剪切:使用超声波或酶消化将染色质剪切成适当大小的片段。
6. 免疫沉淀:将剪切后的染色质与特异性抗体孵育,然后添加蛋白A/G磁珠。
7. 洗涤:用低盐、高盐和LiCl洗涤液洗涤磁珠,去除非特异性结合物。
8. 洗脱:用洗脱缓冲液洗脱DNA。
9. 逆转交联:用蛋白酶K处理,然后在65°C下加热过夜以逆转交联。
10. DNA纯化:使用商业试剂盒或标准酚/氯仿方法纯化DNA。
11. 分析:使用qPCR分析富集的DNA,或进行测序以确定蛋白质结合位点。
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Co-IP(Co-Immunoprecipitation,共免疫沉淀)的实验方法通常包括以下步骤:
1. 细胞培养与裂解:细胞在适宜的培养条件下生长到适当的密度。
蛋白质分离:裂解后的细胞混合物通过离心去除未破碎的细胞碎片和未裂解的细胞。收集上清液
2. 抗体的添加:将特异性抗体(针对目标蛋白质的抗体)加入到裂解物中。
3. 免疫复合物的形成:抗体与目标蛋白结合后,形成免疫复合物。
4. 亲和介质的使用:向混合物中添加蛋白A或蛋白G结合的珠子(如琼脂糖或磁性珠子)。
5. 免疫复合物的捕获:将混合物与珠子孵育一段时间后,使用磁铁或离心的方法将珠子收集起来,同时捕获了与之结合的免疫复合物。
6. 洗涤:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和其他分子。
7. 洗脱:使用适当的缓冲液将免疫复合物从珠子上洗脱下来,常用的缓冲液包括SDS样品缓冲液,用于后续的电泳分析。
8. 蛋白质分析:洗脱的蛋白质可以通过SDS-PAGE凝胶电泳、Western blot、质谱分析等方法进行进一步分析。
9. 实验对照:实验中应包括阳性对照和阴性对照,以确保实验结果的可靠性。
10. 数据分析:对实验结果进行分析,确认目标蛋白是否成功沉淀,并鉴定任何可能的相互作用蛋白。
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