蛋白酶用于生成肽，用于质谱分析蛋白质。这些应用包括蛋白质组学和生物制药的深度表征。由于遗漏了切割和样品制备诱导的伪影，传统的蛋白酶并不总是理想的，因此需要具有不同特异性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一种精氨酸特异性蛋白酶，可将蛋白质 C 末端消化为精氨酸残基。与胰蛋白酶肽相比，所得肽更长，并可能导致序列覆盖率增加。质谱分析中蛋白酶的特异性对于获得高质量的数据集和避免复杂的数据解释至关重要。作为模型底物，使用胰岛素氧化β链来比较 GingisREX 和 ArgC 的酶特异性。胰岛素氧化β链含有一个精氨酸和一个赖氨酸残基。在RP-HPLC和质谱法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在赖氨酸残基上没有酶活性或其他额外活性，即使在长时间孵育过夜后，酶与底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸残基上显示出主要活性，但在赖氨酸残基上也可以看到酶消化。在酶与底物的比例为 1：20 和过夜孵育下，证明了 ArgC 的额外非特异性活性。在相同条件下，GingisREX未检测到这种情况。数据证实了GingisREX精氨酸残基的特异性活性，并显示使用Arg-C在赖氨酸和其他残基处的非特异性消化。FabRICATOR（IdeS）酶是生物制药行业中普遍使用的工具。北京GlycINATORIdeS蛋白酶
对于携带突变铰链的 Fc 融合蛋白或抗体来说，Fab 和 Fc 片段的生成可能具有挑战性。Genovis的GingisKHAN酶在铰链上方一个可触及的赖氨酸位点消化人IgG1，在足够温和的还原条件下保留链内和链间二硫键，从而产生完整的Fab和Fc片段。对于融合蛋白，消化通常在铰链上方获得，但融合伴侣的结构和氨基酸序列可能导致其他暴露的消化位点。如果去除保守的 Fc N-聚糖，Fc 中的第二个切割位点也可能被GingisKHAN酶切。将精选的单克隆人 IgG1 抗体和 Fc 融合蛋白与 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小时，并通过 HPLC 进行分析。湖北GlycINATORIdeS蛋白酶抗体酶切为了降低度拉糖肽复杂性，使用GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖，并用DTT还原链间二硫键。
为了让所有实验室都能同时快速自动消化多种抗体，Genovis的FabRICATORMagIC的设计具有灵活性，适用于一系列自动化平台。我们在ThermoScientific™KingFisher™纯化系统上优化了FabRICATORMagIC的工作流程，但它可以转移到其他自动化平台，如果没有自动化，在振动台上也能同样出色地工作。消解后，将含有处理样品的深孔板直接转移到LC-MS的自动进样器中进行快速色谱分析，或转移到其他分析方法进行分析。FabRICATORMagIC与在消解缓冲液中添加0.05%聚山梨醇酯20兼容，以极大限度地减少自动化系统中可能发生的纯粹压力。使用KingFisher仪器处理样品时，样品制备非常简单。将样品、树脂和缓冲液移液到指定的孔或板中，然后将板放入仪器中。设计用于FabRICATORMagIC的BindIt™协议将控制每个步骤的孵育温度和时间。
大多数商业zhiliao性抗体属于IgG类，在Fc结构域中含有N-聚糖。一个重要的关键质量属性是糖基化曲线，因为它会影响稳定性、溶解度、药效学和药代动力学特性。这种翻译后修饰可能发生在生物工艺开发和制造过程中，因此需要密切监测。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶已成为一种被接受的快速表征单克隆抗体（mAb）的分析工具。FabRICATOR在铰链下方消化IgG，产生F（ab'）2和Fc/2片段。单个FabRICATOR消解位点和质量谱的后续精度使Fc糖基化谱能够检测，从而可以监测批次间的一致性和其他关键质量属性。为了分别研究度拉糖肽的肽和 Fc 区域，从而鉴定结构域特异性 PTM。
抗体 Fc 糖基化谱是一种重要的 CQA，因为它会影响疗效、和免疫原性。因此，需要从早期开发、工艺开发到质量控制和批量放行的整个过程对Fc聚糖谱进行监测。传统的分析方法基于对游离的聚糖进行荧光标记，然后通过HILIC-HPLC或CE进行分析，这需要多步骤的样品制备方案，这需要大量的时间和资源。使用Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb，然后使用LC-MS进行中级分析，为Fc聚糖分析提供了一种快速、直接的替代方法。如上所示，它很容易实现自动化，以提高通量并降低处理错误的风险。用Genovis的GlySERIAS 消化，所有三个连接子区域均被消解。青海GingisKHANIdeS蛋白酶IgG特异性蛋白酶
瑞典生物技术公司Genovis提供IdeS蛋白酶等，用于mAb、ADC药物的开发、生产和质量控制。北京GlycINATORIdeS蛋白酶
其他基于 IgG 的生物制药需要仔细表征和监测关键质量属性，例如氧化、糖基化和其他翻译后修饰。与抗体的克隆选择、工艺开发和稳定性研究相关的大量样品通常通过液相色谱质谱 （LC-MS） 进行分析。然而，在LC-MS之前进行足够规模的样品制备通常具有挑战性。为了解决样品制备的挑战，Genovis将半胱氨酸蛋白酶FabRICATOR（IdeS）固定在磁性琼脂糖珠上，现在称为FabRICATOR MagIC。FabRICATOR固定在磁珠上，可同时快速自动消化多种抗体，促进中级表征工作流程。Genovis的FabRICATOR MagIC 如何以较少的用户交互减少实验和操作时间，降低样品处理错误的风险，同时提高通量。北京GlycINATORIdeS蛋白酶
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