LAMP法,即环介导等温扩增法(Loop-mediated isothermal amplification),在支原体检测中的应用具有以下特点和应用场景:
1. 日常监测:由于LAMP法的快速和简便性,它适用于生物实验室的日常监测,可以及时检测出支原体的存在,确保实验结果的准确性和可靠性。
2. 疾病诊断:LAMP法已被成功应用于SARS、禽流感、HIV等疾病的检测中,并在2009年甲型H1N1流感事件中发挥了重要作用。
3. 临床应用:LAMP法在临床样本的检测中显示出了快速、高灵敏度和稳定性,可以用于检测实验室样本及临床样本中的支原体。
4. 多病原体检测:LAMP法可以同时检测多种病原体,包括肺炎支原体在内的多种下呼吸道感*的病原体,为临床诊疗提供询证依据。
5. 与其他技术结合:LAMP法可以与CRISPR-Cas12a等其他技术结合,建立新的检测方法,提高检测的效率和准确性。
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巢式PCR法和一步法恒温支原体检测试剂盒各有优缺点,具体哪个更好要根据实验需求和条件来决定。
1. 巢式PCR法通过两轮PCR扩增来提高检测的特异性和灵敏度。它的优点是:
2. 特异性强,可以减少假阳性结果。
3. 灵敏度高,可以检测到很低数量的支原体。
4. 通过设计多对引物,可以覆盖多种支原体种类。
不过巢式PCR法也存在一些缺点:
1. 操作复杂,需要两轮PCR反应。
2. 容易受到PCR抑制物的影响,产生假阴性结果。
3. 反应后需要开盖电泳检测,增加了污染的风险。
而一步法恒温支原体检测试剂盒采用等温扩增技术,具有以下优点:
1. 操作简便,只需一次反应即可完成检测。
2. 灵敏度和特异性也很高,可检出10个拷贝以上的支原体污染。
3. 反应后无需开盖,减少了污染的风险。
但一步法试剂盒的缺点是:
1. 灵敏度虽高,但可能略低于巢式PCR法。
2. 价格可能比巢式PCR试剂盒要高。
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细胞培养中如果污染了支原体,会有以下几种影响:
1. 细胞生长受影响:支原体污染会导致细胞生长速度减慢,甚至停止生长。细胞可能会变圆,从培养瓶壁脱落。
2. 细胞形态变化:虽然某些细胞在支原体污染后形态变化不明显,但有些细胞会出现体积增大,细胞碎片增多,培养瓶中细胞间隙出现膜状沉积等现象。
3. 代谢和功能改变:支原体污染会影响细胞的代谢和功能,例如培养液中的精氨酸被大量消耗,引起细胞蛋白质、DNA、rRNA、mRNA的合成障碍。支原体活动还可能引起培养液成分和pH值的变化。
4. 实验结果受影响:使用被支原体污染的细胞进行实验会严重影响实验结果,因为支原体会抑制细胞生长,导致染色体畸变,细胞膜抗原性改变,细胞复苏后存活率降低等。
5. 细胞培养环境的污染:一株污染的细胞可能成为实验室的污染源,对工作区域以及培养箱和液氮罐造成污染,进而污染其他细胞,导致其他细胞继发性污染。
6. 科研结果的重复性问题:由于支原体污染,某些实验结果可能能在支原体阳性的细胞中得到,导致科研结果的重复性受到影响
支原体污染是细胞培养中普遍的问题之一,细胞库中或正在使用的细胞中,支原体的污染率约为15%-35%。并对培养细胞的生理和代谢造成诸多影响:
01/ 争夺营养:支原体的污染会阻碍细胞生长和增殖
02/ 改变蛋白质、RNA 或 DNA 合成的水平
03/ 改变基因表达、细胞信号传导和形态
04/ 损害膜和细胞器
05/ 导致突变和染色体变化
06/ 时间、金钱和有价值的细胞丢失:支原体的污染会导致严重的经济损失以及研究时间损失
07/ 实验结果的不可靠性
08/ 生物安全问题
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对于同一个样品,如果PCR检测结果为阳性而一步法恒温检测试剂盒结果为阴性,可能的原因包括:
1. 灵敏度差异:PCR方法通常具有较高的灵敏度,可以检测到单个拷贝的支原体DNA。相比之下,一步法恒温检测试剂盒可能需要更高的支原体拷贝数才能检测出阳性结果,例如需要10^3个拷贝。如果样品中的支原体数量低于一步法试剂盒的检测阈值,就可能出现PCR阳性而一步法阴性的情况。
2. 检测范围:PCR检测可以针对特定的支原体序列设计引物,如果样品中的支原体种类或序列与一步法试剂盒的检测范围不完全匹配,可能导致一步法检测不出。
3. 样品处理和提取:一步法恒温检测试剂盒可能对样品的处理和DNA提取有特定的要求。如果样品处理不当或DNA提取效率不高,可能会影响一步法试剂盒的检测结果。
4. 试剂盒特异性:一步法恒温检测试剂盒可能设计用于检测特定的支原体种类,如果样品中的支原体与试剂盒的特异性不匹配,可能导致假阴性结果。
5. 抑制物的影响:PCR检测可能对样品中的某些抑制物不那么敏感,而一步法恒温检测试剂盒可能更容易受到这些抑制物的影响,从而降低检测的灵敏度。
支原体及污染方式有哪些?上海细胞培养支原体预防试剂
支原体检测方法LAMP法?上海细胞培养支原体预防试剂
qPCR法,即定量聚合酶链式反应(Quantitative Polymerase Chain Reaction)法,是一种高度灵敏和特异的分子生物学技术,用于检测和定量DNA序列。在支原体检测中,qPCR法的原理主要包括以下几个步骤:
1. DNA提取:首先从待测样本中提取DNA,这可能包括细胞培养上清液或组织样本中的支原体DNA。
2. 设计特异性引物:针对支原体的保守DNA序列,如16S rRNA基因,设计特异性的DNA引物。
3. 荧光标记探针:使用荧光标记的探针,该探针与目标DNA序列互补,能够在PCR扩增过程中与扩增的DNA结合。
4. Ct值确定:Ct值(阈值循环数)是指在PCR反应中,荧光信号强度超过预定阈值的循环次数。Ct值越低,表示样本中支原体DNA的量越多。
5. 定量分析:通过标准曲线法或相对定量法,将Ct值转换为支原体DNA的定量结果。
qPCR法的优势在于其高灵敏度和特异性,能够检测到非常低水平的支原体污染,并且可以在短时间内提供结果,这对于需要快速检测的生物制品生产和细胞培养质量控制非常重要
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