木糖氧化产碱菌木糖氧化亚种

大肠杆菌属的系统发育：大量属于该物种的菌株已得到分离和鉴定。除了血清型(videsupra)，它们还可以根据它们的系统发育(即推断的进化史)进行分类。如下所示，其中该物种分为六组。特别是全基因组序列的使用产生了高度支持的系统发育。基于这些数据，大肠杆菌的5个亚种被区分开来。系统发育距离(“关联性”)和病理学之间的联系很小，例如O157：H7血清型菌株形成一个分支(“一个独特的群”)—下面的E群——都是肠出血性菌株(EHEC)，但并不是所有的EHEC菌株都是密切相关的。事实上，四种不同的志贺氏菌嵌套在大肠杆菌菌株(见上)，然而E.albertii和E.fergusonii不属于这个群体。事实上，在包括类型菌株在内的系统基因组研究中，所有志贺菌都被放在大肠杆菌的一个亚种内，因此很难进行相应的重新分类。所有常用的研究菌株大肠杆菌属于a组，主要来源于Clifton的K-12菌株(λ⁺f⁺。O16)并且在较小程度上来自d'Herelle的大肠杆菌菌株(B菌株)(O7)。UPEC是一群常见的病原大肠杆菌。木糖氧化产碱菌木糖氧化亚种

枯草芽孢在净化水质，降低氨氮，在减少死鱼上作用非常明显。枯草芽孢杆菌在菌体生长过程中，产生的枯草菌素、多粘菌素，制霉菌素、短杆菌肽等活性物质，这些活性物质对致病菌或内源性影响的条件致病菌，有明显的抑制作用。枯草芽孢杆菌生长速度快，对营养要求比较低，能高效分解许多蛋白质、有机质及代谢产物，且不会产生毒类素，是一种无致病性的安全微生物。壤水分、温度和有机质含量对枯草芽孢杆菌的生长繁殖均有影响，一般情况下，适宜植物生长的条件和环境也适宜枯草芽孢杆菌的生长和繁殖，反之，干旱、低温和有机质匮乏对枯草芽孢杆菌的生长繁殖不利。木糖氧化产碱菌木糖氧化亚种金黄色葡萄球可以存活于高盐环境，至高可以耐受15%浓度的NaCl溶液。

典型的金黄色葡萄球菌为球型，显微镜下排列成葡萄串状。金黄色葡萄球菌无芽胞、鞭毛，大多数无荚膜。革兰染色阳性。金葡菌具有抗干燥、耐热、耐低温、耐高渗的特性。在干燥环境中存活数月；空气中存在，但不繁殖。加热70℃1h，80℃30min不被杀死。在冷冻食品中不易死。在含有50%～66%蔗糖或15%以上食盐食品中才可被抑制，能在15%NaCl和40%胆汁中生长。金黄色葡萄球菌是院内传染及社区获得性传染的常见细菌之一。随着ß-内酰胺类维生素的普遍应用，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)随之增加，且引起的传染和病死率有逐年增加的趋势。MRSA可通过接触途径进行传播，即易感人群从携带者或传染者身上获得MRSA，导致传播流行。

一些研究已经研究了大肠杆菌的蛋白质组。到2006年，4237个开放阅读框架中的1627个(38%)已经通过实验确定。给出了大肠杆菌K-12的4639221个碱基对序列。在注释的4288个蛋白质编码基因中，38%没有被赋予任何功能。与其他五种已测序的微生物进行比较，发现其基因家族普遍存在，且分布较窄。大肠杆菌内部有许多相似基因的家族也很明显。至大的旁系同源蛋白质家族包含80个ABC转运蛋白。基因组作为一个整体，就局部复制方向而言是惊人地有组织的。鸟嘌呤、寡核苷酸可能与复制和重组有关，而且大多数基因都是定向的。基因组还包含插入序列(IS)元件、噬菌体残余物和许多其他异常组成的斑块，表明基因组通过水平转移具有可塑性。枯草芽孢杆菌的芽孢形成后菌体不膨大。

由于枯草芽孢杆菌有很强的生物同化作用，可应用于清理畜禽养殖场的粪便恶臭，其代谢产物对蚊蝇的生长繁殖也有抑制作用。采用圈舍喷洒、加入发酵床垫料等途径，可以有效地改善饲养环境。枯草芽孢杆菌对植物病菌的作用机制是多样的，概括起来主要有竞争作用、拮抗作用、溶菌作用、诱导植物抗病性和促进植物生长等。竞争作用主要包括营养竞争和位点竞争。营养和空间位点的竞争是指存在于同一微小生物环境中的两个或两个以上微生物之间争夺这一环境内的空间、营养、氧气等的现象。拮抗作用主要指2种或2种以上的微生物共同生长时，一种微生物在同化作用中产生某种或某几种特异的次生代谢产物，改变其微环境，从而抑制甚至杀死另一种微生物的现象。枯草芽孢杆菌菌体自身会合成α-淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、纤维素酶等酶类。奥德赛赖氨酸芽孢杆菌菌株

金黄色葡萄球大多数能分解葡萄糖、麦芽糖和蔗糖，产酸不产生气。木糖氧化产碱菌木糖氧化亚种

SHBCCD24589短小芽胞杆菌SHBCCD24590罗伊氏乳杆菌SHBCCD24591罗伊氏乳杆菌SHBCCD24592陶厄氏菌SHBCCD24593皮生球菌属SHBCCD24594蜡状芽孢杆菌SHBCCD24595脱硫副球菌SHBCCD24596维氏气单胞菌SHBCCD24597产氮假单胞菌SHBCCD24598克劳氏芽孢杆菌SHBCCD24599根瘤菌SHBCCD24600生金色链霉菌（金霉素链霉菌）SHBCCD24601福氏志贺氏菌SHBCCD24602乳酸克鲁维酵母SHBCCD24603乳酸克鲁维酵母SHBCCD24604紫色直丝链霉菌SHBCCD24605明亮发光杆菌T3小种SHBCCD24606铜绿假单胞菌MZ01SHBCCD24607大肠杆菌K88SHBCCD24608天蓝色链霉菌SHBCCD24609酿酒酵母SHBCCD24610铜绿假单胞菌噬菌体SHBCCD24611威尼斯芽孢杆菌SHBCCD24612云南微球菌SHBCCD24613莓实假单胞菌SHBCCD24614三叶草根瘤菌SHBCCD24615普通脱硫弧菌SHBCCD24616小球藻（蓝细菌）SHBCCD24617许氏醋酸杆菌SHBCCD24617SHBCCD24618费氏弧菌SHBCCD24619产超广谱β-内酰胺酶HSV-4大肠杆菌SHBCCD24620乙型溶血性链球菌=ATCC21059SHBCCD24621鼠伤寒沙门氏菌噬菌体SHBCCD24622金黄色葡萄球菌噬菌体SHBCCD24623金黄色葡萄球菌SHBCCD24624W31**肠杆菌菌种SHBCCD24625铜绿假单胞菌PAO1SHBCCD24626甲型溶血性链球菌SHBCCD24627化脓性链球菌 木糖氧化产碱菌木糖氧化亚种

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